Short RNA の deep sequencing substraction と assembly で病原体同定

何かの病原体に感染した細胞を直接ショットガンシークエンシングして直接病原体のRNA配列を検出しましょう、というお話。
血清と違って細胞を潰すとホストのRNAがバックグラウンドとしてガッツリ(9割以上とか)でてくるのでそれをどうやって減らすかが課題なのだが、短いRNAを取ってくると"病原体RNA/ホストRNA"比が改善するので de novo に病原体RNAを検出しやすいですよね、というお話。